স্লিপ অ্যাপনিয়া হরমোন নিয়ন্ত্রণ ব্যাহত করে এবং শুক্রাণুর গুণমান, যার মধ্যে গতিশীলতা ও সংখ্যাও রয়েছে, সেগুলিকে নেতিবাচকভাবে প্রভাবিত করার মাধ্যমে পুরুষদের প্রজনন ক্ষমতাকে প্রভাবিত করতে পারে।

স্লিপ অ্যাপনিয়ার চিকিৎসা গর্ভধারণের সম্ভাবনা বাড়াতে পারে। অবস্ট্রাকটিভ স্লিপ অ্যাপনিয়ায় আক্রান্ত নারীরা বন্ধ্যাত্বের উচ্চ ঝুঁকিতে থাকেন।